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1925年，由美國本篤會在北京創設大學預科「北京公教大學附屬輔仁社」，此即輔仁大學的前身「輔仁社」，這一年就成為輔仁大學校史的元年。1927年，北洋政府核定正名為「輔仁大學」。輔仁大學哲學系就在這一年展開她的發展史，以下表列各時期的重要事蹟：
| 1927 | 輔仁大學（北平）籌設哲學系 |
|---|---|
| 1928 | 哲學系正式招生 |
| 1929-33 | 哲學系隸屬文學院 |
| 1934-48 | 哲學系併入「哲學心理系」下「哲學組」，隸屬教育學院 |
| 1949-52 | 恢復「哲學系」仍隸屬教育學院 |
| 1952 | 輔仁大學受高校整併，哲學系併入北京大學哲學系，其餘各單位併入北京師範大學 |
| 1959 | 于斌樞機受教廷任命輔大校長，籌備在台復校 |
| 1960 | 教育部核准輔仁大學在台復校 |
| 1961 | 哲學研究所碩士班招生 所長：高思謙(61-69) |
| 1963 | 哲學系招生 系主任：高思謙(63)、李貴良(64)、王秀谷(65)、錢志純(66-69)、張振東(69-87) |
| 1969 | 哲學研究所博士班招生 所長：錢志純(70-79, 82-86)、李振英(80-81)、張振東(87-90)、王臣瑞(91-93)、陳福濱(93-95) |
| 1972 | 《哲學論集》第一期出刊 |
| 1988 | 哲學系擴招雙班（愛班、智班）系主任：黎建球(87-93) |
| 1991 | 哲學系獲得教育部發展特色系所計畫補助成立士林哲學研究中心(INSTITUTE OF SCHOLASTIC PHILOSOPHY) |
| 1992 | 李振英校長指示舉辦第一屆海峽兩岸學術研討會（爾後與中國人民大學哲學院每年輪辦，持續舉辦已逾20餘年） |
| 1992 | 「夜間部哲學系」招生（慧班），隸屬「夜間部」。 |
| 1993 | 系主任：陳福濱(93-99) |
| 1995 | 哲學系系所合一 |
| 1997 | 夜間部哲學系調整為進修部哲學系 |
| 1999 | 士林哲學研究中心改隸文學院 |
| 2002 | 教育部顧問室「人文社會科學教育改進計畫」補助成立「西洋古典暨中世紀哲學資料中心」 系主任：丁福寧(99-02) 、黎建球(02-04) |
| 2002 | 召開「哲學系師友學術研討會」。「哲學系教材教法研討會」（每年持續辦理已逾10餘年） |
| 2005 | 碩士在職專班招生 系主任：潘小慧(04-10)、陳福濱(10-11)、傅玲玲(11-12)、丁福寧(12-14)、尤煌傑(14-17)、邱建碩(17- 23)、張存華(23- ) |
| 2008 | 士林哲學研究中心併入天主教學術研究院 |
| 2009 | 《哲學與文化》月刊獲得AHCI收錄（自416期起）（發行人：黎建球，社長：潘小慧，主編：尤煌傑） |
| 2010 | 哲學系與心理學系、臨床心理學系共同成立「哲學諮商與輔導學分學程」隸屬文學院 |
| 2011 | 「進修部哲學系學士班」正式歸建於輔大哲學系，自此輔大哲學系成為擁有「進修部學士班」、「日間部學士班」、「碩士班」、「碩士在職專班」、「博士班」五個學制的哲學教育單位，在學學生總人數超過七百餘名。 |
| 2013 | 《哲學論集》由年刊改為半年刊 系主任：丁福寧(12-14) |
| 2014 | 推動文學院與馬來亞大學合作開設暑期「基本人文素養」專班。系主任：尤煌傑(14-17) |
| 2015 | 輔仁大學哲學系獲選QS世界大學聲望調查排名150+ |
| 2017 | 系主任：邱建碩(17-23) |
| 2018 | 哲學系加入COMIUCAP (Conférence Mondiale des Institutions Universitaires Catholiques de Philosophie 天主教大學哲學機構世界聯盟 http://www.comiucap.net/) ，成為正式機構會員 |
| 2020 | 進修部學士班停招 |
| 2021 | 哲學系與成均館大學儒學院簽訂博士碩士雙聯學位協議 |
| 2023 | 系主任：張存華(23- ) |
| 2024 | 輔仁大學哲學系於QS世界大學聲望調查中排名哲學領域201-210位 |